动植物基因组重测序

    动植物基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。通过生物信息手段,分析不同个体基因组间的结构差异, 同时完成注释基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点(SNPs)、拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型,以最廉价的方式将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征,这在人类疾病及动植物育种研究等方面具有重大的指导意义。利用全基因组重测序有助于快速发现与动植物重要性状相关的遗传变异,缩短分子育种的实验周期;有助于发现人类疾病相关的重要变异基因,加快生物医药研发的速度等。随着测序技术的进一步发展和测序物种的增加,重测序作为科学研究的一项重要手段将会越来越多的被采用。
 

一、全基因组重测序技术路线:

二、全基因组重测序信息学分析:
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.基因组序列拼装与分析 
3.根据客户需求进行个性化分析
 
三、送样要求:
1.品纯度要求: OD值应在1.8至2.0之间;电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。
2.样品浓度:浓度不低于200ng/ul;样品总量不低于500ug。
3.请提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。
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