动植物基因组De novo 测序

     基因组De novo 测序,是指不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列,从而推进该物种的研究,在新基因的发现、物种改良等方面发挥巨大作用。

    随着第二代高通量测序技术的成熟和广泛应用,基因组测序的成本将会大大降低,测序时间也将进一步大幅缩短,越来越多的实验室也有能力独立开展动植物基因组测序项目,大型的动植物基因组测序将不再遥不可及。

    我公司长期从事大型的动植物基因组研究工作,具备每年同时进行多个大型基因组测序和分析的能力。      

一、技术路线:

二、信息学分析
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.基因组序列拼装与分析
3.功能元件分析

4.定制化分析

 

三、送样要求:

1.品纯度要求: OD值应在1.8至2.0之间;电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。
2.样品浓度:浓度不低于200ng/ul;样品总量不低于500ug。
3.请提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。

 

四、成功案例:

木瓜基因组计划——Papaya Genome Project

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