真菌基因组完成图

真菌基因组完成图

    据估算,全世界真菌约有150万种,现已知有11 200余属,中国已知1万种以上。真菌是一类分布最广的生物,因此,合理利用有益真菌,控制和预防有害真菌对人类的生产和生活具有重要的意义。而真菌基因组的阐明,将为真菌特性的分析提供有用的依据。天津生物芯片利用基因组光学图谱工作仪辅助第二代高通量测序技术,并配备了一套指导序列拼接的软件系统,可以提供更高效、低成本的真菌基因组“完成图”测序等科研项目。

应用范围:
 适用于所有真菌菌株;
 尤其适合超高GC/超低GC真菌;
 其它用传统方法测序比较困难真菌;
 真菌基因组草图或精细图补洞。

技术优势:

(1)丰富的经验,基于十余年基因组学研究经验及强大的生物信息学综合技术平台支持,为客户提供从制定研究计划到获得研究成果的全面解决方案。

(2)专业的实验团队,为实验结果的真实可靠提供保障。更高的N50组装指标 ,更少的contig数量 可以达到99.999%准确率 。

(3)强大的生物信息学分析团队,我公司拥有一支优秀的生物信息学团队,团队中80%的工作人员具有博士学位,长期从事生物信息学分析,实现基本生物信息学分析标准化、流程化,个性化分析定制化,确保高水平和低成本的基因组分析结果。

技术路线

 

   首先利用Roche 454平台及Illumina平台对真菌基因组进行测序, 并利用光学图谱技术辅助基因组组装, 获得了染色体水平的真菌基因组测序结果。

生物信息学分析内容

1、原始数据进行去除接头序列及低质量reads处理;
2、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估;
3、序列拼接;
4、基因注释 、基因功能分析 、KEGG通路分析;

5、基因组比较及进化分析,新基因预测;

6、 可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。

 
 
成功案例

 

实验周期

从客户获得合格样品后90个工作日内完成文库构建、上机测序和生物信息学分析工作
53客服