细菌基因组完成图

细菌基因组完成图

     天津生物芯片拥有自主的PacBio RS II测序平台,与二代测序平台相结合,建立了细菌完成图测序新策略,首推的细菌基因组完成图测序新策略,进一步缩短了测序周期,最短2周内即可完成基因组测序和生物信息学分析;

适用范围
1. 普通细菌快速完成图构建;
2. 尤其适合超高GC/超低GC细菌;
3. 其它用传统方法测序比较困难菌株;
4. 已完成细菌基因组草图或精细图补洞。

 TBC优势

1、实验安排灵活、服务周期短、速度快
天津生物芯片拥有自主的PacBio RS II测序平台可根据合作伙伴具体需要灵活安排实验。此外,首推的细菌基因组完成图测序新策略,进一步缩短了测序周期,最短2周内即可完成基因组测序和生物信息学分析;
2、测序结果准确性更高   
细菌基因组完成图测序的新策略联合应用了PacBio RS II, Genome Analyzer IIx平台,结合数十年细菌基因组学研究的经验累积,多方面保证了拼接结果准确,一致性序列的准确性达99.999%以上,为合作伙伴提供最大程度的质量保障;

测序平台 单碱基错误率 Gap Contig
PacBio RS II平台      
+ < 十万分之一 0 1
Genome Analyzer IIx平台      

3、测序成本更低         
测序新策略降低了测序试剂成本和人工成本,基因组完成图测序的成本更低,最低仅需4万元。
 生物信息学分析内容

1、原始数据进行去除接头序列及低质量reads处理;
2、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估;
3、序列拼接;
4、基因注释 、基因功能分析 、KEGG通路分析;

5、基因组比较及进化分析,新基因预测;

6、可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。

天津生物芯片已完成的项目
自2005年开始至今,天津生物芯片利用不同测序平台已经完成细菌基因组完成图测序超过100株,非完成图测序超过2000株,相关研究成果发表在Nature、PNAS、Genome Biology、Journal of Bacteria等权威期刊发表论文超过120篇。丰富的科研经验以及全新的测序策略,使天津生物芯片在环境细菌基因组学测序及分析方面处于国内领先地位,可以更好地为合作伙伴的科研项目服务!
 

实验周期

从客户获得合格样品后60个工作日内完成文库构建、上机测序和生物信息学分析工作
  

技术优势:

(1)丰富的经验,基于十余年基因组学研究经验及强大的生物信息学综合技术平台支持,为客户提供从制定研究计划到获得研究成果的全面解决方案。

(2)专业的实验团队,为实验结果的真实可靠提供保障。最高的N50组装指标 ,最少的contig数量 可以达到99.999%准确率 。

(3)强大的生物信息学分析团队,我公司拥有一支优秀的生物信息学团队,团队中80%的工作人员具有博士学位,长期从事生物信息学分析,实现基本生物信息学分析标准化、流程化,个性化分析定制化,确保高水平和低成本的基因组分析结果。

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