宏基因组学

    宏基因组学( metagenomics)是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系等为研究目的的新的微生物研究方法,也称为微生物环境基因组学、元基因组学或生态基因组学。主要研究从环境样品获得的基因组中所包含的微生物的遗传组成及其群落功能,为充分认识和开发利用非培养微生物,并从完整的群落水平上认识微生物的活动、最大限度地挖掘微生物资源提供了可能。
    宏基因组de novo测序是指对环境样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序,进行序列组装和基因注释,获得部分不可纯培养微生物的基因组序列,分析该环境下所有微生物基因集信息。
一、 技术路线:
 


二、信息学分析
1.标准信息学分析

1)原始数据整理、过滤及质量评估

2)基因集分析

3)物种丰度分析

4)群落结构分析

5)微生物基因组序列组装和拼接

2.定制化信息学分析
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。


三、技术优势
1. 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台(Roche 454 FLX+、Illumina Solexa ),实验周期短,质量可靠。
2. 拥有专业的宏基因组学技术人员,可以根据客户的不同要求提供个性化实验方案。
3. 拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可为客户提供个性化的生物信息分析服务。


四、实验周期
 从客户获得合格样品后40个工作日内完成文库构建、上机测序和生物信息学分析工作。


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