基因组光学图谱

 天津生物芯片于2012年引进国内首台Argus基因组光学图谱工作站,并配备了一套用于基因组光学图谱指导序列拼接的软件系统。该软件系统能够将基因组光学图谱技术与原始测序数据有效结合,获得高质量的全基因组序列图谱。天津生物芯片结合公司已有的微生物图谱信息库,利用Argus基因组光学图谱工作站可以高效、精确地将组装的基因组序列定位到染色体上,可以完成真菌基因组“完成图”测序,比较基因组及菌株分型等科研项目。

Argus 基因组光学图谱工作站
Argus基因组光学图谱工作站服务领域

"真菌基因组完成图"测序完美解决方案

 

2012年至今,天津生物芯片技术有限责任公司与南开大学合作建立了基于OpGen公司的Argus系统的基因组光学图谱工作站,并针对细菌、真菌和动植物进行了基因组光学图谱(Optical Mapping)分析,并建立了成熟的从样品处理到结果解析的标准操作流程。
 高通量序列拼接结果矫正分析
   随着测序技术的发展,完成测序的基因组越来越多,但由于基因组自身结构特点(杂合度和重复区等),以及测序技术及拼接原理局限性等原因(读长和库长较短),基因组错拼事件经常发生。基因组光学图谱技术因其拼接准确性较高被誉为评价基因组拼接质量的“金标准”,可以很好地矫正高通量测序拼接结果中的错误,特别是由于重复区造成的大尺度的错拼。

指导序列拼接,显著增加大型生物基因组序列拼装质量
   与二代测序技术相结合,利用指导基因组光学图谱序列拼接的软件系统,以光学图谱信息为构建Super-Scaffold,填充Gaps,增加测序覆盖区域,降低大型生物基因组测序成本,增加基因组拼装效果。
 大型生物基因组序列拼装效果

 天津生物真菌研究技术路线

比较基因组及菌株分型
      通过基因组光学图谱比较,快速地揭示基因组间的相似性和差异性、了解基因组结构变异。
 比较基因组及菌株分型
   菌株鉴定
     结合天津生物芯片已有的微生物图谱信息库,通过图谱比对,可以将微生物鉴定到菌株水平。

菌株水平 效果图

更多应用问题请点击基因组光学图谱常见问题

天津生物芯片优势
   2012年引进国内首台Argus基因组光学图谱工作站,并配备了一套用于基因组光学图谱指导序列拼接的软件系统;
   天津生物芯片技术有限责任公司与南开大学合作,建立了成熟的从样品处理到结果解析的标准操作流程;
   实验室从2012年7月引进该平台至今,已经完成5株真菌和2株植物的基因组光学图谱分析。
基因组光学图谱工作原理

 

 

 
 基因组光学图谱工作原理
 
 
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