当前位置:首页 > 技术平台 > Solexa 测序

Solexa 测序

第二代分析系统Genome Analyzer IIx是当前世界上应用广泛的新一代测序系统。具有高准确性、高通量、高灵敏度和低运行成本等突出优势。可以同时完成传统基因组学研究以及功能基因组学研究。为目前遗传分析和功能基因组等研究领域提出了全新的应用方案。

     
工作原理:
   边合成边测序。即生成新DNA互补链时,要么加入dNTP通过酶促级联反应催化底物激发出荧光,要么直接加入被荧光标记的dNTP或半简并引物,在合成或连接生成互补链时,释放出荧光信号。通过捕获光信号并转化为一个测序峰值,获得互补链序列信息。

 

技术优势:
   应用广泛,适用于基因组、表观基因组和转录组研究。

   通量灵活,测序成本较低,读长可达到2×150 bp,每个flow cell读取片段数量可达6.4亿以上。

   测序准确性较高,通过不断完善更新测序试剂盒算法软件系统,2X100bp读长时,Q20以上数据能够达到95%以上。

应用领域:
基因组De novo测序
   基因组De novo 不用任何参考序列对某个物种进行测序,用生物信息学方法进行组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。Genome Analyzer Iix测序平台具有测序通量高、测序成本低的特点,能够在短时间内获得大量不同插入长度的原始数据作为De novo拼接得数据基础,结合Roche 454及sanger测序平台使用,不同平台优势互补,将可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列,从而推进该物种的研究。

转录组测序
   转录组即某个物种或特定细胞在某个功能状态下产生的所有的RNA总和,转录组测序是研究细胞表型和功能的一个重要手段。利用Genome Analyzer Iix测序平台可以实现大多数的物种及细胞类型的转录组测序,特别是针对原核生物的转录组测序,建立了完善的原核生物核糖体RNA消除技术,可以有效消除原核生物核糖体RNA对转录组测序的影响。

基因组重测序
   全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。建立了一套发现不同个体之间单核苷酸多态性位点(SNPs)、拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型的标准化操作流程,并自主研发的RecDetect程序(用于区分重组和突变),为基因组水平的比较基因组和进化分析提供技术保证。

小RNA测序
   小RNA 是生物体内一类重要的功能分子,它能够诱导基因沉默,调控细胞生长,发育,基因转录和翻译等生物过程。建立了一套适用于各个物种的小RNA深度鉴定与定量分析的测序方法和分析方法,可以有效实现小RNA的预测、鉴定、定位及功能鉴定的实验技术和生物信息学分析方法。

染色体免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)
   染色质免疫共沉淀技术测序是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,利用该技术不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰以及转录因子与基因表达的关系。建立了一套染色质免疫共沉淀技术测序标准实验流程和分析方法。

 

53客服