细菌测序

 1.极端嗜酸甲烷氧化细菌V4基因组学研究PDF
    温室效应的加剧正在导致全球气候变暖。甲烷是第二重要的温室气体,仅排在CO2之后。一些特殊的细菌可以利用环境中的甲烷来生长,被称为甲烷利用细菌。它们扮演着生物过滤器的角色,减少了散发到大气中的甲烷数量,对全球温室效应有重要影响。
    课题组与新西兰GNS极端微生物研究组、夏威夷大学微生物系合作,在新西兰发现了一株全新的甲烷利用细菌。这株细菌不同于已知的甲烷氧化菌,可以在高度酸性(pH2.0-2.5)的环境中生长,并且分类上与现有的甲烷利用细菌(Methanotroph)属于不同的门。基因组学研究发现,该菌拥有一个与众不同的甲烷利用方式,并且寻找到三个可能的甲烷单加氧酶,确定了甲烷利用的新途径。这一研究成果于2007年12月6日发表在国际顶级学术杂志《自然》(Nature)上,该成果加深了人们对于甲烷利用细菌的种属、生态及遗传多样性认识,为进一步控制和利用自然甲烷提供了基础。

 

Phylogenetic 16S rRNA gene tree showing the position of isolate V4 relative to other members of the phylum Verrucomicrobia and to proteobacterial methanotrophs.

 

Trasmission electron micrographs of internal memberane structures observed in some cells of Verrucomicrobia isolate V4.

Phylogenetic tree constructed from derived PmoA and AmoA sequences.
53客服